EHEC גרינגער צו באַשטימען
ניו דיאַגנאָסטיק טעכניק: גענאָמע פון די EHEC פּאַטאַדזשאַן ריקאַנסטראַקטיד גלייך פֿון פּאַציענט מאַטעריאַל פֿאַר די ערשטער מאָל
מעדיציניש מיקראָביאָלאָגיסץ פון דעם אוניווערסיטעט האַמבורג-עפּענדאָרף (UKE), צוזאַמען מיט בריטיש סייאַנטיס און עמפּלוייז פון די ביאָטעטשנאָלאָגי פירמע Illumina, האָבן ריקאַנסטראַקטיד די גאַנץ גענאָמע סיקוואַנס פון די פּאַטאַדזשאַן וואָס געפֿירט די EHEC עפּידעמיע אין 2011 גלייַך פֿון בענקל סאַמפּאַלז פון ינפעקטאַד פּאַטיענץ. די וויסנשאפטלער אנגעפירט פון פראפ דר. מארטין אפלבאטשער. עס ינייבאַלז די לעגיטימאַציע און ברייט כאַראַקטעריזיישאַן פון ינפעקטיאָוס אגענטן אָן די געוויינטלעך קאַלטיוויישאַן אין דער לאַבאָראַטאָריע.די רעזולטאַטן פון לערנען ארויס אין אַ ספּעציעל נומער פון די פּרעסטידזשאַס מעדיציניש זשורנאַל JAMA¹ אויף מיטוואך, אפריל 10.
די EHEC ויסברוך אין פרי זומער 2011, געפֿירט דורך די באַקטיריאַ פון די מין Escherichia coli גערופֿן STEC O104:H4, געוויזן די ריזיק שעדיקן וואָס אַ ינפעקציע עפּידעמיע קען פאַרשאַפן אפילו אין אַ מאָדערן, העכסט ינדאַסטריאַלייזד געזעלשאַפט. אין דער צייט זענען מער ווי 3000 מענטשן אינפעקטירט געווארן, מער ווי 50 פון זיי זענען אומגעקומען און ווארשיינליך הונדערטער ליידן נאך היינט פון די נאכפאלגונגען. "בעשאַס אַזאַ אַן עפּידעמיע, ווי די יחיד קאַסעס פון קראַנקייַט זענען דעלט און ווי די פּאַטאַדזשאַן ספּרעדז ווייַטער דעפּענדס קריטיש אויף ווי געשווינד די ויסברוך שפּאַנונג קענען זיין יידענאַפייד און קעראַקטערייזד," דערקלערט פּראָפעסאָר אַעפּפעלבאַטשער, דירעקטאָר פון דעם אינסטיטוט פֿאַר מעדיציניש מיקראָביאָלאָגי, וויראָלאָגי און היגיענע.
ביז אַהער, באַקטעריע פּאַטאַדזשאַנז האָבן צו זיין קאַלטאַווייטאַד אין דער לאַבאָראַטאָריע און דערלאנגט אין זייער ריין פאָרעם איידער זיי קענען זיין אַנאַלייזד אין דעטאַל. "אין דעם פאַל פון עטלעכע פּאַטאַדזשאַן מינים, אפילו דעם קאַלטיוויישאַן איז לאַנג אָדער אפילו אוממעגלעך; אין אנדערע פאלן, די פעלן פון נאָרמאַל טעסץ פֿאַר פייַן טייפּינג מאכט עס שווער צו ידענטיפיצירן ויסברוך סטריינז, "דערקלערט מיקראָביאָלאָגיסט דר. מארטין קריסטלעך.
אין דעם קראַנט לערנען, אַזוי גערופענע מעטאַגענאָמיק מעטהאָדס זענען געניצט פֿאַר די ערשטער מאָל צו פאָרשן אַ ויסברוך מיט אַ באַקטיריאַל פּאַטאַדזשאַן. מאָדערן סיקוואַנסינג טעקניקס און ספּעציעל דעוועלאָפּעד ביאָינפאָרמאַטיק מעטהאָדס זענען געניצט. פֿאַר די רעטראַספּעקטיוו אַנאַליסיס, 45 בענקל סאַמפּאַלז פון פּאַטיענץ ינוואַלווד אין די EHEC ויסברוך זענען פּראַסעסט און סיקוואַנס. די דנאַ סיקוואַנסיז באקומען זענען יגזאַמאַנד פֿאַר סימאַלעראַטיז און קאַמפּערד מיט סיקוואַנסיז פון בענקל סאַמפּאַלז פון געזונט וואַלאַנטירז. פּראָפעסאָר Aepfelbacher: "אין דעם וועג, ספּעציפיש דנאַ סעקשאַנז וואָס אָנווייַזן די ויסברוך שפּאַנונג קען זיין יידענאַפייד אין די קאָמפּלעקס בענקל מעטאַגענאָמעס. עטלעכע קאפיעס פון די גענעטיק מאַטעריאַל פון STEC O104:H4 זענען געפֿונען אין רובֿ פון די סאַמפּאַלז. אָ104: ה4 איז געפונען אָדער סאַלמאָנעללאַ ענטעריקאַ קענען זיין דיטעקטאַד.
"די סאַקסעסאַז פון פאָרשונג באַווייַזן די היפּש פּאָטענציעל פון מעטאַגענאָמיקס ווי אַן אָפֿן-געענדיקט, קולטור-פרייַ אופֿן צו ידענטיפיצירן און קעראַקטערייזינג באַקטיריאַל פּאַטאַדזשאַנז," דערקלערט פּראָפעסאָר אַעפּפעלבאַטשער. זיין קאָלעגע דר. מארטין קריסטנער איז קאַנווינסט אַז "די גיך אַנטוויקלונג פון סיקוואַנסינג טעקנאַלאַדזשיז דערווייַל באמערקט וועט אין אַלע מאַשמאָעס ניט בלויז פאַרגרעסערן די גיכקייַט און סענסיטיוויטי פון די דיסקרייבד מעטהאָדס, אָבער וועט אויך רעדוצירן די קאָס צו אַזאַ אַ מאָס אַז זיי קענען זיין געוויינט אין רוטין קליניש פיר. ."
ליטעראַטור:
104Loman עט על., א קולטור-ינדעפּענדענט סיקוואַנס-באזירט מעטאַגענאָמיקס צוגאַנג צו די ויספאָרשונג פון אַ ויסברוך פון שיגאַ-טאָקסיגעניק עסטשעריטשיאַ קאָלי אָ4: ה2013, דזשאַמאַ. 309; 14 (1502): 1510-XNUMX; בנימצא פאַר-עמבאַרגאָ צו די מידיאַ אין http://media.jamanetwork.com)
מקור: האַמבורג [ וקע ]
