Metabolism Stress - geenivariantide tuvastatud riskitegurid
Ainevahetushaigused, eelkõige rohkem esineb tüüp 2 diabeet on tagajärjed keerukas vastasmõjus geneetilise eelsoodumuse ja ebasoodsad elutingimused. Teadlased Helmholtz Zentrum München ja LMU on nüüd esimest korda näitavad seost geneetilise meik isiku ja erinevusi ainevahetuse tasakaalu. Määramine neist geenivariantide lubada tulevikus üksikute ohtude ennustamiseks seoses teatud haiguste, nagu diabeet.
Meeskond ümber prof Dr. Karsten Suhre Müncheni Helmholtzi keskuse ja Müncheni Ludwig Maximiliani ülikooli (LMU) bioinformaatika ja süsteemibioloogia instituudist ning Dr. Christian Gieger ja Privatdozent Dr. Thomas Illig Helmholtz Zentrum Müncheni epidemioloogiainstituudist määras koostöös Innsbrucki ettevõttega Biocrates Life Sciences AG kindlaks mitusada metaboliiti ja samal ajal enam kui 100 000 DNA varianti (SNP) 284 täiskasvanud katsealuse vereväärtused. Aluse moodustasid populatsioonipõhise KORA uuringu (Augsburgi piirkonna terviseuuringud, mida juhib prof dr H.-Erich Wichmann) osalejate vereproovid.
Kombineerides ulatuslikke geneetilisi andmeid metaboliitandmetega, tuvastasid teadlased mitme geeni variandid (SNP-d). Need koodid sisaldavad ensüüme, mis täidavad keha rasvade, suhkrute ja süsivesikute olulisi ülesandeid. Isikutel, kes erinevad seda tüüpi geenivariantide kaudu, ilmneb samaaegselt mõjutatud ensüümide erinev aktiivsus, mis kajastub seerumis erinevates metaboliitide kontsentratsioonides.
"Lihtsustatult öeldes on tegemist inimestega, kellel on geneetiliselt määratud erinevad metaboliidimustrid ehk metabotüübid," selgitab Suhre. Need on vähemalt osaliselt võrreldavad juuksevärvi erinevate väljendustega: ka see on teadaolevalt tingitud geneetilistest variatsioonidest. Näiteks punapäised on päikesekiirguse suhtes tundlikumad kui tumedajuukselised.
Sama võib olla ka siin tuvastatud geneetiliste variatsioonidega, mis vastutavad erinevate metabotüüpide eest. Kui üks rühm suudab suhteliselt jõuliselt reageerida "metaboolsele stressile", nagu lühiajaline toidukaristus või kõrge rasvasisaldusega toit, võib teine rühm kogeda enam-vähem väljendunud kehalisi kahjustusi, mille täpset ulatust saab nüüd uurida järeluuringutes. Suhre: "Erinevalt juuksevärvist, mis vaatajale esmapilgul silma hakkab, on ainevahetuse korral tunduvalt keerulisem tuvastada rolli, mida vastav geenivariant mängib asjaomase inimese ainevahetuses."
Selle uuringuga õnnestus instituutideülesel töörühmal esimest korda kogu genoomi analüüsi kaudu tuvastada mitu sellist seost. Metaboolse tasakaalu geneetiliselt määratud variatsioonide kindlakstegemist saab tulevikus kasutada teatud meditsiiniliste fenotüüpidega seotud riskide ennustamiseks, võimalikeks reaktsioonideks uimastiravile,
Kasutatakse toitumis- või keskkonnamõjusid. Tulemused on seega esimene samm patsientide geneetilisel ja metaboolsel iseloomustusel põhineva personaalse meditsiini ja toitumise poole.
Weitere Informationen:
Algväljaanne: C. Gieger, L. Geistlinger, E. Altmaier, M. Hrabé de Angelis, F. Kronenberg, T. Meitinger, H.-W. Mewes, H.-E. Wichmann, KM Weinberger, J. Adamski, T. Illig, K. Suhre, Geneetika kohtub metaboloomikaga: inimese seerumis leiduvate metaboliitide profiilide kogu genoomi hõlmav uuring, PLoS Genetics, 28.11.2008. november XNUMX
Allikas: Neuherberg [HZM]
