Mikroblar üçün yeni sınaq prinsipi
Bakterial metabolitlər üçün zond kimi floresan DNAzimlər
Qidada olan mikroblar, bioterrorizm, bakteriya və virusların müqaviməti - bunlar patogenləri mümkün qədər erkən müəyyən etməyi xüsusilə vacib edən dövrümüzün bəzi problemlərindəndir. Ənənəvi üsullar ya yavaş olsa da, ya da mürəkkəb avadanlıq tələb etsə də, Yingfu Li və Hamiltondakı McMaster Universitetinin (Ontario, Kanada) komandası Sentinel Bioaktiv Kağız Şəbəkəsi tərəfindən dəstəklənən indi mikrobları tez aşkar edən xüsusilə sadə, universal flüoresan test sistemi hazırlayıblar. və xüsusilə onların metabolitlərindən birinə əsaslanır. Tədqiqatçıların Angewandte Chemie jurnalında bildirdiyi kimi, testin hansı maddəyə reaksiya verdiyini bilmək belə lazım deyil.
Ənənəvi olaraq mikroblar mikrobioloji yolla aşkarlanır; bu yüksək dəqiqlik olsa da, günlər və hətta həftələr çəkə bilər. PCR və ya antikor əsaslı üsullar sürətlidir, lakin bir çox addımlar və xüsusi avadanlıq tələb edir. Li deyir: "Bizim ağlımızda xüsusilə sadə, lakin sürətli və dəqiq bir üsul var idi. O, həm də universal olmalıdır, yəni eyni prinsipdən istifadə edərək istənilən mikrob üçün testlər hazırlanmalıdır".
“Patogen bir mühitdə metabolizə edildikdə və çoxaldıqda, ətraf mühitə müxtəlif maddələr ifraz edir. Biz bunlardan istifadə etmək istəyirdik” Li deyir. İdeyası: mikrob üçün xüsusi məhsula reaksiya verən DNT-zimləri istehsal etmək. DNAzimlər katalitik aktivliyə malik süni tək zəncirli DNT molekullarıdır. İstənilən xüsusiyyətlərə malik molekullar təkrarlanan seçim və gücləndirmə mərhələləri ilə təsadüfi ardıcıllıqla böyük bir DNT molekulu hovuzundan inkişaf etdirilə bilər.
Layihələndirilmiş DNAzimin ürəyi tək bir RNT nukleotidindən ibarətdir. Onun sağına və soluna flüoresan boya və söndürücü bərkidilir. Söndürən, boyanın yanında olduqda onun flüoresansını söndürən bir molekuldur. Tədqiqatçılar koliform bakteriyaların spesifik metabolik məhsulunu bağlayan və bu prosesdə onun formasını dəyişən DNT-zimi hazırlayıblar. Bu dəyişdirilmiş formada DNAzim RNT-parçalama xüsusiyyətlərinə malikdir və RNT nukleotidinin yerləşdiyi nöqtədə öz ipini kəsir. Bu söndürücü və boyanı ayırır və boya floresan etməyə başlayır. Floresensiya nümunədə koliform bakteriyaların olduğunu göstərir. Lakin bu DNAzim digər bakteriyalara reaksiya vermir.
Li deyir: "Prinsipcə, hədəflənmiş seçim vasitəsilə hər hansı bir mikrob üçün xüsusi DNT-zim tapıla bilər. Nə bu metabolik məhsulu bilmək, nə də onu nümunədən təcrid etmək lazım deyil." Normal hüceyrə kulturası addımından istifadə edərək, mikroblar sınaqdan əvvəl nümunə tapılmalıdır ki, tək bir hüceyrə hələ də aşkarlana bilsin.
Müəllif: Yingfu Li, McMaster Universiteti, Ontario (Kanada), http://www.science.mcmaster.ca/biochem/faculty/li/
Tətbiqi Kimya 2011, 123, №. 16, 3835–3838, Məqaləyə daimi keçid: http://dx.doi.org/10.1002/ange.201100477
Mənbə: Weinheim [GDCh]
