Métabolisme sous stress - Variations génétiques identifiées comme facteurs de risque

Les maladies métaboliques, en particulier le diabète de type 2 de plus en plus fréquent, sont le résultat d'une interaction complexe entre une prédisposition génétique et des conditions de vie défavorables. Des scientifiques du Helmholtz Zentrum München et du LMU ont pu montrer pour la première fois un lien entre la constitution génétique d'une personne et les différences d'équilibre métabolique. L'identification de ces variations déterminées génétiquement pourra à l'avenir permettre de prédire individuellement les risques vis-à-vis de certaines maladies, comme le diabète.

L'équipe autour du Prof. Dr. Karsten Suhre de l'Institut de bioinformatique et de biologie des systèmes du Centre Helmholtz de Munich et de l'Université Ludwig Maximilians de Munich (LMU), ainsi que le Dr. Christian Gieger et le professeur particulier Dr. Thomas Illig de l'Institut d'épidémiologie du Helmholtz Zentrum München, en coopération avec la société d'Innsbruck Biocrates Life Sciences AG, a déterminé les valeurs sanguines de plusieurs centaines de produits métaboliques (métabolites) ainsi que de plus de 100 000 variantes d'ADN (SNP) de 284 sujets adultes. La base ici était des échantillons de sang provenant de participants à l'étude KORA (Cooperative Health Research in the Augsburg Region, dirigée par le professeur Dr. H.-Erich Wichmann) basée sur la population.

En combinant des données génétiques complètes avec des données sur les métabolites, les scientifiques ont identifié des variantes (SNP) dans plusieurs gènes. Ceux-ci codent pour des enzymes qui effectuent des tâches importantes dans l’équilibre des graisses, des sucres et des glucides du corps. Les personnes qui diffèrent les unes des autres en raison de telles variantes génétiques ont également des activités différentes des enzymes affectées, ce qui se reflète dans différentes concentrations de métabolites dans le sérum.

"En termes simples, il s'agit de personnes présentant différents modèles de métabolites, c'est-à-dire des métabotypes, déterminés génétiquement", explique Suhre. Celles-ci sont au moins en partie comparables aux différentes caractéristiques de la couleur des cheveux : on sait également que cela est dû à des variations génétiques. Les personnes aux cheveux roux, par exemple, réagissent plus sensiblement au soleil que les personnes aux cheveux foncés.

Les variations génétiques identifiées ici et responsables de différents métabotypes pourraient être similaires. Alors qu'un groupe peut réagir de manière relativement robuste à un « stress métabolique » tel qu'une famine de courte durée ou une alimentation riche en graisses, l'autre groupe peut souffrir de déficiences physiques plus ou moins prononcées, dont l'étendue exacte peut désormais être étudiée lors du suivi. études. Suhre : "Contrairement à la couleur des cheveux, qui est évidente au premier coup d'œil, dans le cas du métabolisme, il est beaucoup plus complexe d'identifier le rôle que joue la variante génétique respective dans le métabolisme de la personne concernée."

Avec cette étude, le groupe de travail inter-instituts a pu pour la première fois cristalliser plusieurs de ces connexions grâce à une analyse à l’échelle du génome. L'identification de variations génétiquement déterminées dans l'équilibre métabolique pourra à l'avenir être utilisée pour prédire les risques liés à certains phénotypes médicaux, aux réactions possibles à un traitement médicamenteux,

Des influences nutritionnelles ou environnementales peuvent être utilisées. Les résultats représentent une première étape vers une médecine et une nutrition personnalisées basées sur la caractérisation génétique et métabolique des patients.

Weitere Informationen:

Publication originale : C. Gieger, L. Geistlinger, E. Altmaier, M. Hrabé de Angelis, F. Kronenberg, T. Meitinger, H.-W. Mewes, S.-E. Wichmann, KM Weinberger, J. Adamski, T. Illig, K. Suhre, La génétique rencontre la métabolomique : une étude d'association à l'échelle du génome des profils de métabolites dans le sérum humain, PLoS Genetics, 28.11.2008 novembre XNUMX.

Source : Neuherberg [HZM]

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